I gruppi funzionali sono gruppi atomici, singoli atomi o tipi di legami presenti all'interno di più categorie di molecole, che conferiscono ad esse specifiche caratteristiche. I principali sono:
| Gruppo Funzionale | Formula Generale | Famiglia | Esempio | Nome IUPAC |
|---|---|---|---|---|
| legame semplice | $\ce{{-}C{-}C{-}}$ | alcani | $\ce{CH3-CH2-CH3}$ | propano |
| legame doppio | $\ce{>C=C<}$ | alcheni | $\ce{CH2=CH2}$ | etene/etilene |
| legame triplo | $\ce{-C#C{-}}$ | alchini | $\ce{CH#CH}$ | etino |
| ossidrile/idrossile/alcolico | $\ce{R-OH}$ | alcoli | $\ce{CH3-CH2-OH}$ | etanolo |
| etere | $\ce{R-O-R'}$ | eteri | $\ce{CH3-O-CH3}$ | dimetil etere |
| tiolico | $\ce{R-SH}$ | tioli | $\ce{CH3-SH}$ | metantiolo |
| (ponte) disolfuro | $\ce{R-S-S-R'}$ | disolfuri | $\ce{CH3-S-S-CH3}$ | dimetil disolfuro |
| carbonilico/carbonile | $\ce{R-(C=O)-H}$ | aldeidi | $\ce{CH3-CHO}$ | etanale |
| $\ce{R-(C=O)-R'}$ | chetoni | $\ce{CH3-CO-CH2CH3}$ | butanone | |
| carbossilico | $\ce{R-(C=O)-OH}$ | acidi carbosslici | $\ce{CH3-COOH}$ | acido etanoico |
| estere | $\ce{R-(C=O)-O-R'}$ | esteri | $\ce{CH3-COO-CH2CH3}$ | etanoato di etile |
| amminico | $\ce{R-NH2}$ | ammine (primarie) | $\ce{CH3-CH2-NH2}$ | etanammina |
| ammidico | $\ce{R-(C=O)-NH2}$ | ammidi (primarie) | $\ce{CH3-CO-NH2}$ | etanammide |
| amminoacidico | H₂N-C-COOH | amminoacidi | H₂N-C-COOH | glicina |